cogs数据库(mcgs数据库)

编程知识 13
今天给各位分享cogs数据库的知识,其中也会对mcgs数据库进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在开始吧!诺基亚智能手机S60的字典数据库是放在哪个文件夹里的? 请参考。诺基亚各个文件夹的作用通讯录        C: SystemDatacontacts.cdb        C:SystemDataCntModel.ini 功能表        C:SystemDataapplications.dat待机状态模式C: SystemDataScShortcutEngine.ini彩信设置C: SystemDataMMS_Settings.dat短信设置C: SystemDatasmsreast.dat,smssegst.dat,sms_settings.dat闹钟设置C: SystemDataAlarmServer.ini连接设置C:SystemDataCdbv3. dat记事本        C: SystemDatanotepad.datWAP书签        C: SystemDataBookmarks1.db情景模式C:SystemDataprofiles 日程表        C: SystemDataCalendarwap相关        C: SystemDatawapstore收藏夹        C: Systemfavourites(可以将这些文件移动到E:systemFavourites中)        C:SystemAppsPhone         删除里面bmp文件可以恢复"中国移动"字样以上文件备份好格式化后考回去,重启手机看看。。。。个性化就全回来啦。。下面以分析一下结构最为复杂的 System文件夹system.ini         这个文件非常重要,设置连接手机属性以后还会生成connect.ini文件MMCSTORE         这个文件当你 的MMC设置了密码后会自动生成。打开就能看到MMC设置的密码Apps                Sis格式的软件                 (用户交互可执行文 件.app                资源文件.rsc                 图标文件.aif                无界面可执行程序. exe                以及运行所需的其 他文件)appsappinst        要用来记录安 装软件的信息appscamcorder        存储与摄 像有关的配置信息appsprofileapp        当前所有情景模式的信息bootdata        统的启动参数和 日志Capability        未知一直空白(英文意思:能力, 性能, 容量, 接受力)Codecs                在安装一些 播放器的解码文件Data                程序所保存设 置的数据文件                (backgroundimage. mbm壁纸                btstate.dat蓝牙配 对信息                Calender日历                 clockapp.dat时间参 数                Contacts.cdb联系人                 以及很多软件的配 置文件和wap信息)favourites        收藏夹的快捷方 式文件*.lnkFep                存放输入法的文 件在安装过"中文之星","Tomken"输入法就有help                软件和游戏附带的帮助文件Fonts                加入新的系统 字体install                反安装的记录 Libs                软件运行时需要的连接库文件Localization        World Clock Pro中城市数据localizer        ZipMan数据 Programs        保存辅助运行文 件,和一些无界面程序exe、动态连接库dll,它和Libs目录相似,一般会自动加载Magic101        安装MGS平台游 戏后出现Mail                存放短消息, MMS,电子邮件以及相关它们的设置Media                安装了一些软 件才会出现MIDIets                java配置文件midp                java程序主体 Mtm                一个关于信息 设置的目录Recogs                存放关联方 式文件Schedules        保存了日程安排 Shareddata        全部是软件的 配置文件.ini(在启动后被自动加载,打不开它。)Skins                安装后的主题 模式文件Temp                临时目录 YReg         

今天给各位分享cogs数据库的知识,其中也会对mcgs数据库进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在开始吧!

诺基亚智能手机S60的字典数据库是放在哪个文件夹里的?

请参考。诺基亚各个文件夹的作用通讯录        C: SystemDatacontacts.cdb        C:SystemDataCntModel.ini 功能表        C:SystemDataapplications.dat待机状态模式C: SystemDataScShortcutEngine.ini彩信设置C: SystemDataMMS_Settings.dat短信设置C: SystemDatasmsreast.dat,smssegst.dat,sms_settings.dat闹钟设置C: SystemDataAlarmServer.ini连接设置C:SystemDataCdbv3. dat记事本        C: SystemDatanotepad.datWAP书签        C: SystemDataBookmarks1.db情景模式C:SystemDataprofiles 日程表        C: SystemDataCalendarwap相关        C: SystemDatawapstore收藏夹        C: Systemfavourites(可以将这些文件移动到E:systemFavourites中)        C:SystemAppsPhone         删除里面bmp文件可以恢复"中国移动"字样以上文件备份好格式化后考回去,重启手机看看。。。。个性化就全回来啦。。下面以分析一下结构最为复杂的 System文件夹system.ini         这个文件非常重要,设置连接手机属性以后还会生成connect.ini文件MMCSTORE         这个文件当你 的MMC设置了密码后会自动生成。打开就能看到MMC设置的密码Apps                Sis格式的软件                 (用户交互可执行文 件.app                资源文件.rsc                 图标文件.aif                无界面可执行程序. exe                以及运行所需的其 他文件)appsappinst        要用来记录安 装软件的信息appscamcorder        存储与摄 像有关的配置信息appsprofileapp        当前所有情景模式的信息bootdata        统的启动参数和 日志Capability        未知一直空白(英文意思:能力, 性能, 容量, 接受力)Codecs                在安装一些 播放器的解码文件Data                程序所保存设 置的数据文件                (backgroundimage. mbm壁纸                btstate.dat蓝牙配 对信息                Calender日历                 clockapp.dat时间参 数                Contacts.cdb联系人                 以及很多软件的配 置文件和wap信息)favourites        收藏夹的快捷方 式文件*.lnkFep                存放输入法的文 件在安装过"中文之星","Tomken"输入法就有help                软件和游戏附带的帮助文件Fonts                加入新的系统 字体install                反安装的记录 Libs                软件运行时需要的连接库文件Localization        World Clock Pro中城市数据localizer        ZipMan数据 Programs        保存辅助运行文 件,和一些无界面程序exe、动态连接库dll,它和Libs目录相似,一般会自动加载Magic101        安装MGS平台游 戏后出现Mail                存放短消息, MMS,电子邮件以及相关它们的设置Media                安装了一些软 件才会出现MIDIets                java配置文件midp                java程序主体 Mtm                一个关于信息 设置的目录Recogs                存放关联方 式文件Schedules        保存了日程安排 Shareddata        全部是软件的 配置文件.ini(在启动后被自动加载,打不开它。)Skins                安装后的主题 模式文件Temp                临时目录 YReg         

百度知道钢七连团队为您解答,谢谢。

手机开机白屏怎么办

白屏一般是由于短信的MCE问题、记忆体损坏、系统错误、MEDIA已关闭、安装或删除游戏后、运行游戏(CS、DOOM)等原因引起的。下面我们就短信引起的问题详细的介绍一下解决白屏的方法!

如:

正常收发短信的时候突然提示数据库错误,然后是系统错误,重复若干次之后自动关机,再次打开后长时间停留在Nokia画面,然后屏幕上部闪烁,白屏重起,然后再出现Nokia画面,闪烁白屏重起,重复若干次后关机.

解决步骤:

先拔卡开机,查看C:systemMail目录中Index.dat文件,这个文件就是所有短信的索引,如果它被破坏了就会引起短信读取不正常,继而无法开机,如果使用充电强起键盘的方法(方法三)能够进入彩屏画面,那你就会发现,短信功能就没有显示,功能表中的短信菜单消失了.那我们所要作的,就是把这个目录移动到E盘,也就是MMC卡中.可以使用MsgDriveE(即短信移动到E盘)来解决.万一Index.dat损坏,没关系.只要拔掉MMC卡开机,由于E盘没有了,系统会自动定义到C盘的Nokiamail中,而我们只要把MMC卡接到读卡器中,删除/nokiamail,再次安装MsgDriveE即可.简单得说,就是数据库错误只发生在E盘,而这个错误只要拔掉MMC卡就能解决.

一、按住笔型键开机,出现nokia标志后狂按对号键(确认键)

二、如果不行再尝试如下操作:

1.取出你的mmc卡.

2.装入读卡器.

3.进入电脑,读取数据.

4.删除mmc卡中的最近安装的文件(如果你是安装的SIS文件,可以用SIS查看器来解压安装的源文件,再来

对照的删除).

三、如果第二法还是白屏无法开机的话,那继续采用“关机充电法”:

关机充电时是可以“强制开机并且使按键有效”(这个很关键,普通白的时候,开机是全无效的)

1.在关机的状态下进行充电,充电时,提示错误,要求确认,这时还不能正常充电.按要求确认就行了,系

统会多次提示错误,就确认多次错误,直到可以正常充电为止

2.拆电池和sim卡,放置一段时间后再装上电池。充电,在显示完所有错误之前不断用“笔+开机键”重启

,直到屏幕出现“NOKIA”的标志后放开开机键,成功后就可以进入安全模式了(系统运行正常是不会进入安全

模式的).

3.如果还是无法开机,那么就要按住笔形键不放,同时按住开机键,然后快速的不间断按确定键,成功后

就可以进入手机菜单界面.

4.拔充电接头,然后接sim卡,重复第二步,使得QD认为“环境正常”“系统错误”。

5.拆sim卡,接电池,不要接充电接头,然后开机,看见可爱(也是可恶)的NOKIA时候,马上插充电接头

,进入强制模式,按开机键开机。

6.如果上一步成功,就可以看见可爱的桌面,提示插入sim卡,它叫你插,你怎么能不插阿,就插它吧.(

这句话未免xxx了一点)不行的话,就关机重启,就会见到彩屏的提示了。

四、如果使用上面的方法没有效果的话,那只能采用以下的方法了,不过通常是可以解决

任何由于软件问题引起的白屏问题。

首先,你必须有读卡器和电脑,把卡取出后,启动机器,之后把卡插回手机中,如果你设置了卡的名字,请把它删除,把C:/SYSTEM/PROGRAM下的所有东西都删除,E:/SYSTEM/中的APPS、DATA、FONTS、RECOGS文件夹保留,其他的删除再启动机器,看是否能顺利启动。如果你没有更改卡的名字,把C:/SYSTEM/PROGRAM下的所有东西都删除,E:/SYSTEM/中的APPS、DATA、FONTS、RECOGS文件夹保留,其他的删除后再启动,如果还是无法进入就直接按照以下方法操作。

1、把卡取出后,通过读卡器把卡里的所有内容CUT到电脑上,自己建个临时文件夹。然后把卡放回手机里,启动机器,看是否能启动通过,如果还是无法启动,请开机后再插卡,把C:/SYSTEM/DATA和APPS(其中包含所有你手机和程序的存档)文件夹复制到你的卡上,再CUT到电脑上,备用。然后请你彻底的格式化一下手机:

*#7370# (如果无法完全格式化,请下载删除字体工具,一般是字体在作怪),初始密码是12345。

2、启动好机器或者格式好机器后,把卡放回卡槽中,通过手机再格式一次卡,这个过程比较漫长,大约需要20分钟(RS-MMC的512M,大约需要20分钟)。

3、在这个漫长的过程中你可以修改一下电脑中从卡上和手机上CUT的文件了,首先把E:/SYSTEM/中的APPS、DATA、FONTS、RECOGS文件夹保留,其他的删除,MIDP文件是保存百宝箱中程序的文件,可以把它CUT到根目录下,以后重新安装,因为所用的JAR程序都保存在里面,可以直接通过SELEQ来选择安装。

如果没有格机的朋友还要把C:/SYSTEM/PROGRAM下的所有东西都删除。

从手机COPY的C:/SYSTEM/DATA/文件中的.APP和.DAT文件都保留,其他的删除,手机启动好后,把这些都

COPY回手机中。

4、然后格式化好卡后,最好不要改卡的名字,设为无就行,如果确实要用自己个性的卡名,不推荐用中文。把

电脑上的所有文件都CUT回卡上,然后启动机器。

5、如果没有格机的朋友,启动时还是停滞在NOKIA的画面上的话,请格一次机器后再按照以上的步骤操作就可

以解决了,一般不必把卡中的东西格式化掉。

6、通过这样的操作一般就可以解决伪白屏的问题,同时劝告大家,要定期的备份你的C下的APPS和名片,以防

万一!

7、提醒:大家最好不要更改卡的名字,设定为无就好

可能是手机和电脑同时读卡的名字(卷标)而引起的冲突

如果还是不行,请去专门的维修站吧。祝你好运! 白屏一般是由于短信的MCE问题、记忆体损坏、系统错误、MEDIA已关闭、安装或删除游戏后、运行游戏(CS、DOOM)等原因引起的。下面我们就短信引起的问题详细的介绍一下解决白屏的方法!

如:

正常收发短信的时候突然提示数据库错误,然后是系统错误,重复若干次之后自动关机,再次打开后长时间停留在Nokia画面,然后屏幕上部闪烁,白屏重起,然后再出现Nokia画面,闪烁白屏重起,重复若干次后关机.

解决步骤:

先拔卡开机,查看C:systemMail目录中Index.dat文件,这个文件就是所有短信的索引,如果它被破坏了就会引起短信读取不正常,继而无法开机,如果使用充电强起键盘的方法(方法三)能够进入彩屏画面,那你就会发现,短信功能就没有显示,功能表中的短信菜单消失了.那我们所要作的,就是把这个目录移动到E盘,也就是MMC卡中.可以使用MsgDriveE(即短信移动到E盘)来解决.万一Index.dat损坏,没关系.只要拔掉MMC卡开机,由于E盘没有了,系统会自动定义到C盘的Nokiamail中,而我们只要把MMC卡接到读卡器中,删除/nokiamail,再次安装MsgDriveE即可.简单得说,就是数据库错误只发生在E盘,而这个错误只要拔掉MMC卡就能解决.

一、按住笔型键开机,出现nokia标志后狂按对号键(确认键)

二、如果不行再尝试如下操作:

1.取出你的mmc卡.

2.装入读卡器.

3.进入电脑,读取数据.

4.删除mmc卡中的最近安装的文件(如果你是安装的SIS文件,可以用SIS查看器来解压安装的源文件,再来

对照的删除).

三、如果第二法还是白屏无法开机的话,那继续采用“关机充电法”:

关机充电时是可以“强制开机并且使按键有效”(这个很关键,普通白的时候,开机是全无效的)

1.在关机的状态下进行充电,充电时,提示错误,要求确认,这时还不能正常充电.按要求确认就行了,系

统会多次提示错误,就确认多次错误,直到可以正常充电为止

2.拆电池和sim卡,放置一段时间后再装上电池。充电,在显示完所有错误之前不断用“笔+开机键”重启

,直到屏幕出现“NOKIA”的标志后放开开机键,成功后就可以进入安全模式了(系统运行正常是不会进入安全

模式的).

3.如果还是无法开机,那么就要按住笔形键不放,同时按住开机键,然后快速的不间断按确定键,成功后

就可以进入手机菜单界面.

4.拔充电接头,然后接sim卡,重复第二步,使得QD认为“环境正常”“系统错误”。

5.拆sim卡,接电池,不要接充电接头,然后开机,看见可爱(也是可恶)的NOKIA时候,马上插充电接头

,进入强制模式,按开机键开机。

6.如果上一步成功,就可以看见可爱的桌面,提示插入sim卡,它叫你插,你怎么能不插阿,就插它吧.(

这句话未免xxx了一点)不行的话,就关机重启,就会见到彩屏的提示了。

四、如果使用上面的方法没有效果的话,那只能采用以下的方法了,不过通常是可以解决

任何由于软件问题引起的白屏问题。

首先,你必须有读卡器和电脑,把卡取出后,启动机器,之后把卡插回手机中,如果你设置了卡的名字,请把它删除,把C:/SYSTEM/PROGRAM下的所有东西都删除,E:/SYSTEM/中的APPS、DATA、FONTS、RECOGS文件夹保留,其他的删除再启动机器,看是否能顺利启动。如果你没有更改卡的名字,把C:/SYSTEM/PROGRAM下的所有东西都删除,E:/SYSTEM/中的APPS、DATA、FONTS、RECOGS文件夹保留,其他的删除后再启动,如果还是无法进入就直接按照以下方法操作。

1、把卡取出后,通过读卡器把卡里的所有内容CUT到电脑上,自己建个临时文件夹。然后把卡放回手机里,启动机器,看是否能启动通过,如果还是无法启动,请开机后再插卡,把C:/SYSTEM/DATA和APPS(其中包含所有你手机和程序的存档)文件夹复制到你的卡上,再CUT到电脑上,备用。然后请你彻底的格式化一下手机:

*#7370# (如果无法完全格式化,请下载删除字体工具,一般是字体在作怪),初始密码是12345。

2、启动好机器或者格式好机器后,把卡放回卡槽中,通过手机再格式一次卡,这个过程比较漫长,大约需要20分钟(RS-MMC的512M,大约需要20分钟)。

3、在这个漫长的过程中你可以修改一下电脑中从卡上和手机上CUT的文件了,首先把E:/SYSTEM/中的APPS、DATA、FONTS、RECOGS文件夹保留,其他的删除,MIDP文件是保存百宝箱中程序的文件,可以把它CUT到根目录下,以后重新安装,因为所用的JAR程序都保存在里面,可以直接通过SELEQ来选择安装。

如果没有格机的朋友还要把C:/SYSTEM/PROGRAM下的所有东西都删除。

从手机COPY的C:/SYSTEM/DATA/文件中的.APP和.DAT文件都保留,其他的删除,手机启动好后,把这些都

COPY回手机中。

4、然后格式化好卡后,最好不要改卡的名字,设为无就行,如果确实要用自己个性的卡名,不推荐用中文。把

电脑上的所有文件都CUT回卡上,然后启动机器。

5、如果没有格机的朋友,启动时还是停滞在NOKIA的画面上的话,请格一次机器后再按照以上的步骤操作就可

以解决了,一般不必把卡中的东西格式化掉。

6、通过这样的操作一般就可以解决伪白屏的问题,同时劝告大家,要定期的备份你的C下的APPS和名片,以防

万一!

7、提醒:大家最好不要更改卡的名字,设定为无就好

可能是手机和电脑同时读卡的名字(卷标)而引起的冲突

如果还是不行,请去专门的维修站吧。

iOS core data可以在app运行过程中修改数据库文件路径吗

C:/SYstem/MAil (手机信息保存路径,把信息路径保存到MMC卡,可以删除,省几十K) C:/SYstem/Apps/chat (聊天室) C:/SYstem/Apps/Manua/VideoEditor (视频剪辑) C:/SYstem/Data/ /AHLE (互联网) /cbs (未知意义,每次开机后都有小许的增大。重命删除,开机自动会生成回) /midp2 (同上的答案,求懂的朋友可以告诉意义) /IMHistory (聊天室) (闹钟文件) (手机设置,不要删除,否则。。。。) (墙纸) (书签,互联网记录) Calendar (日历,待办事项记录) (聊天室) (时钟) (未知意义,可以删除,开机自动生成回) Calcsoft (计算机) (记事本) (聊天室,有两个相同名称文件,其中一个是1。62K的这个是同步处理) (短信常用短语模板) Pinboard (捷径) (单位换算) (视频播放记录) (未知意义,可以删除,开机自动生成回)下面是C盘 系统文件夹下的文件C:systemAppsC:systemAppsApplnst 这个文件是用来记录安装软件的信息,随着软件安装的增多而增大。C:systemAppsPhotoAlbum 图片浏览器的初始化文件C:systemAppsprofileApp手机的数据库文件,用来记录安装软件的信息,随着软件安装的增多而增大。C:systemAppsSystemExplorer 这个文件夹就是SeleQ软件的安装文件夹C:systembootdata 手机导入数据文件夹。文件夹中的、 、、、这5个文件大小固定不变的,分别为17b、0b、16b、70b、4b。其中是记录SIM卡语言种类的。C:systemData这个文件夹记录程序初始化或运行时的数据的。C:SystemDateAHLE互联网C:systemDatacbs 这个文件夹下有两个dat文件,其中的大小不变,为71bC:SystemDatemidp2未知意义,每次开机后都有小许的增大。重命删除,开机自动会生成回C:systemDatasaveddecks 这个文件夹默认为空,作用与手机服务商的网络有关。C:systemDatawapstore 这个文件夹主要用来存储用WAP上网时的一些设定和网页缓存。C:systemData程序数据记录C:systemData保存在系统中的墙纸图片文件C:systemData 书签数据文件,用来记录WAP地址。C:systemData 安装各种软件的证书文件诺C:systemDataCalcsoft自带的计算器C:systemDataCalendar 手机自带的日历C:systemData 时钟设定存档文件C:systemData 电话本初始化文件C:systemData 电话本数据文件,随着电话本记录的增多而增大。C:systemData手机的通讯数据文件,包括来电,去电,通话时间,GPRS流量等等。C:systemData多媒体播放器RealOne播放机。C:systemData彩信设置全C:SystemDate 音乐播放器C:systemData 默认大小为1bC:systemData记事本C:systemDataPinboard 捷径C:systemData C:systemData 手机的短信设定存档文件C:systemData手机短信信模版文件C:systemData手机自带的单位转换器初始化文件C:systemData 和媒体声音有关的数据文件C:systemData WAP设定存档文件,初始化大小为59b。C:systemfavourites 收藏夹,初始化为空。C:systemfavourites 快捷键增加的文件位置及名称C:systeminstall文件夹中还会有你安装的软件的sis记录文件C:systeminstall 在手机中安装软件的日志文件。C:Systemlibs 软件连接文件和库文件,DLL文件诺基亚C:systemMail 短信息存储文件夹。C:SystemMIDIets JAVA程序文件C:systemMtm信息设置目录C:Systemrecogs 存放关联方式文件的目录C:systemSchedules 待办事宜数据文件。C:systemShareddata手机功能设定文件,包括手机设备设置、通话设置、连接设置、时间设置、网络设置等。更改Tools-Settings里面的设置后,这个文件夹里的文件就会发生变化。C:SystemTemp 存储临时文件的文件夹,初始化为空。C:System 系统初始化配置文件。C:Sytstem 备份数据

手机白屏了怎么办?

一、当手机出现白屏后,我们按住手机的开关机键,将手机进行重启,看看手机有没有反应。如果手机能够正常重启的话,那么就表面白屏是由于系统出错造成的,手机完成重启解锁后就可以正常使用了。

二、此时按下手机的开关机键没有反应或者是不能进行关机的话,那么此时的问题很有可能是因为手机系统死机所导致的。这时我们可以同时按住苹果手机的开关机键+HOME键不松开,等待一会后,手机就会强制重启。手机重启后,看看问题是否得到了解决。

三、如果重启不能解决手机白屏的问题,那么还可以通过刷机的方法来解决白屏的问题,但是刷机的话会删除手机上的所有数据,所以需要谨慎操作。

将手机用数据线与电脑上的iTuns进行连接,然后下载最新版本的固件或者是当前手机系统的固件版本。

然后让手机进入到恢复模式,先将手机关机,接着按住手机电源键3秒,然后再同时按住手机的电源键和音量-键大概10秒钟左右,并且手机的屏幕显示连接了iTuns,此时就可以松手了,这就代表我们成功进入到手机的恢复模式中了。

常用的查询蛋白质结构以及序列的数据库主要有哪些?

1. PIR和PSD

PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库,其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。所有序列数据都经过整理,超过99%的序列已按蛋白质家族分类,一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。PSD的注释中还包括对许多序列、结构、基因组和文献数据库的交叉索引,以及数据库内部条目之间的索引,这些内部索引帮助用户在包括复合物、酶-底物相互作用、活化和调控级联和具有共同特征的条目之间方便的检索。每季度都发行一次完整的数据库,每周可以得到更新部分。

PSD数据库有几个辅助数据库,如基于超家族的非冗余库等。PIR提供三类序列搜索服务:基于文本的交互式检索;标准的序列相似性搜索,包括BLAST、FASTA等;结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索,包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索GeneFIND等。

2. SWISS-PROT

SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库,由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。数据库由蛋白质序列条目构成,每个条目包含蛋白质序列、引用文献信息、分类学信息、注释等,注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关系、序列变异体和冲突等信息。SWISS-PROT中尽可能减少了冗余序列,并与其它30多个数据建立了交叉引用,其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。

利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索SWISS-PROT和其它EBI的数据库。SWISS-PROT只接受直接测序获得的蛋白质序列,序列提交可以在其Web页面上完成。

3. PROSITE

PROSITE数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式,并能根据这些位点和模式快速和可靠地鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质家族。有的情况下,某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低,但由于功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式,这样就可能通过PROSITE的搜索找到隐含的功能motif,因此是序列分析的有效工具。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等;除了序列模式之外,PROSITE还包括由多序列比对构建的profile,能更敏感地发现序列与profile的相似性。PROSITE的主页上提供各种相关检索服务。

4. PDB

蛋白质数据仓库(PDB)是国际上唯一的生物大分子结构数据档案库,由美国Brookhaven国家实验室建立。PDB收集的数据来源于X光晶体衍射和核磁共振(NMR)的数据,经过整理和确认后存档而成。目前PDB数据库的维护由结构生物信息学研究合作组织(RCSB)负责。RCSB的主服务器和世界各地的镜像服务器提供数据库的检索和下载服务,以及关于PDB数据文件格式和其它文档的说明,PDB数据还可以从发行的光盘获得。使用Rasmol等软件可以在计算机上按PDB文件显示生物大分子的三维结构。

5. SCOP

蛋白质结构分类(SCOP)数据库详细描述了已知的蛋白质结构之间的关系。分类基于若干层次:家族,描述相近的进化关系;超家族,描述远源的进化关系;折叠子(fold),描述空间几何结构的关系;折叠类,所有折叠子被归于全α、全β、α/β、α+β和多结构域等几个大类。SCOP还提供一个非冗余的ASTRAIL序列库,这个库通常被用来评估各种序列比对算法。此外,SCOP还提供一个PDB-ISL中介序列库,通过与这个库中序列的两两比对,可以找到与未知结构序列远缘的已知结构序列。

6. COG

蛋白质直系同源簇(COGs)数据库是对细菌、藻类和真核生物的21个完整基因组的编码蛋白,根据系统进化关系分类构建而成。COG库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。利用COGNITOR程序,可以把某个蛋白质与所有COGs中的蛋白质进行比对,并把它归入适当的COG簇。COG库提供了对COG分类数据的检索和查询,基于Web的COGNITOR服务,系统进化模式的查询服务等。

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